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Estructura primaria: Secuencia de aminoácidos , descripcion de todos los enlaces covalentes principalmente puentes disulfuro y enlaces peptidicos
Superfamilias: homología 30 % ,Familias:superior a un 50 % Y la misma función, por lo general.
Enzimas que rompen enlaces peptidicos :tripsina, Quimotripsina , pepsina ,papaina
Predicciones a partir de estructura primaria : Homologia Hidrofobicidad , Estructura secundaria . Retención cromatográfica en HPLC , Residuos accesibles y ocultos , Mutabilidad
Estructura Secundaria : Plegamiento que la cadenapolipeptidica adopta gracias a la formacion de ptes de H. , entre los atomos q forman el enlace peptidico
se forman estructuras : alfa- helice ,Lamina Beta , Giro B
alfa-helice: mioglobina (p.globular) , fibrinogeno (p. fibrosa)
lamina B: fibroina (p.fibrosa)
Estructuras Suprasecundarias: Hélice-vuelta-hélice ; Siete hélices transmembrana y hélice anfipática ; Cremallera de leucina ; Unidad bab ; Meandro b ; Dedo de Zn ; Mano EF
Determinación de la estructura secundaria:
Métodos físicos: Cristalografía Rayos X ; Resonancia Magnética Nuclear (RMN, NMR) , Otras técnicas: dicroísmo circular
Estructuras terciaria: Estructura tridimencional de la proteina
Fuerzas que Mantienen la Estructura Terciaria:
No covalentes : - Efecto hidrofóbico : se realiza de manera que los Aa apolares (hidrofogos) se situan hacia el interior de la proteina y los polares hacia el exterior
-Enlaces de hidró geno:Aceptores: Histidina ,cisteina, metionina Ac Glutamico, Glicina, Asparagina
Dadores: tirosina, serina treonina, lisina,arginina, glutamina
- Interacciones iónicas o salinas : Lys, Arg , His ,Glu
Covalentes : Enlace disulfuro ; Enlace amida
Clase 1:alfa ,-no faciculada.-faciculada,-peptidos pequeños
Clase 2:beta,.ej:barril-porina,helice-hemopexina,solenoide-pectatoliasa.Clase 3:alfa-beta,barril-triosafosfato Isomerasa, herradura-inhibidor de ribonucleasa .Clase 4 irregular:lectinade pisum sativo.
Estructura Cuaternaria: Es la dispocicion espacial de las distintas cadenas polipeptidicas de una proteina multimerica
Fuerzas que Mantienen la Estructura Terciaria: Las mismas q terciaria
Proteinas con estructuras cuaternarias : hemoglobina; concanavalina ; Aspartato transcarbamilasa ; glucogeno fosforilasa
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Superfamilias: homología 30 % ,Familias:superior a un 50 % Y la misma función, por lo general.
Enzimas que rompen enlaces peptidicos :tripsina, Quimotripsina , pepsina ,papaina
Predicciones a partir de estructura primaria : Homologia Hidrofobicidad , Estructura secundaria . Retención cromatográfica en HPLC , Residuos accesibles y ocultos , Mutabilidad
Estructura Secundaria : Plegamiento que la cadenapolipeptidica adopta gracias a la formacion de ptes de H. , entre los atomos q forman el enlace peptidico
se forman estructuras : alfa- helice ,Lamina Beta , Giro B
alfa-helice: mioglobina (p.globular) , fibrinogeno (p. fibrosa)
lamina B: fibroina (p.fibrosa)
Estructuras Suprasecundarias: Hélice-vuelta-hélice ; Siete hélices transmembrana y hélice anfipática ; Cremallera de leucina ; Unidad bab ; Meandro b ; Dedo de Zn ; Mano EF
Determinación de la estructura secundaria:
Métodos físicos: Cristalografía Rayos X ; Resonancia Magnética Nuclear (RMN, NMR) , Otras técnicas: dicroísmo circular
Estructuras terciaria: Estructura tridimencional de la proteina
Fuerzas que Mantienen la Estructura Terciaria:
No covalentes : - Efecto hidrofóbico : se realiza de manera que los Aa apolares (hidrofogos) se situan hacia el interior de la proteina y los polares hacia el exterior
-Enlaces de hidró geno:Aceptores: Histidina ,cisteina, metionina Ac Glutamico, Glicina, Asparagina
Dadores: tirosina, serina treonina, lisina,arginina, glutamina
- Interacciones iónicas o salinas : Lys, Arg , His ,Glu
Covalentes : Enlace disulfuro ; Enlace amida
Clase 1:alfa ,-no faciculada.-faciculada,-peptidos pequeños
Clase 2:beta,.ej:barril-porina,helice-hemopexina,solenoide-pectatoliasa.Clase 3:alfa-beta,barril-triosafosfato Isomerasa, herradura-inhibidor de ribonucleasa .Clase 4 irregular:lectinade pisum sativo.
Estructura Cuaternaria: Es la dispocicion espacial de las distintas cadenas polipeptidicas de una proteina multimerica
Fuerzas que Mantienen la Estructura Terciaria: Las mismas q terciaria
Proteinas con estructuras cuaternarias : hemoglobina; concanavalina ; Aspartato transcarbamilasa ; glucogeno fosforilasa
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