Proteínas

En la formación de todas esas vesículas intervienen diversas proteínas del citosol que se dirigen a la cara citosólica de las membranas de los diferentes compartimentos (retículo endoplásmico, complejo de Golgi, membrana plasmática), para formar, a partir de ellas, las vesículas. Sobre esas membranas se forma un revestimiento con varias clases de proteínas de recubrimiento. De la naturaleza de estas proteínas depende el tipo de transporte vesicular que ocurrirá, es decir; entre que compartimentos se realizará. Así:
Proteína Tipo de transporte vesicular .
CLATRINA.........Membrana plasmática „³ Lisosomas (Endocitosis) y Red trans-Golgi „³ Lisosomas
COP I.................Golgi (red cis) „³ Retículo endoplásmico y Golgi ? Golgi
COP II................Retículo endoplásmico „³ Golgi (red cis)
Este receptor reconoce y une proteínas que se dirigen al lumen lisosomal (que están marcadas por manosas-6-fosfatos) por la porción del receptor de la manosa 6 fosfato localizada en el lumen del complejo de Golgi (pues se trata de una proteína transmembra-na). La adaptina se une también, y a la vez, a la por-ción citosólica del receptor. Finalmente, la clatrina, se une a la adaptina y los trisqueliones rodean el área de membrana del Golgi donde se acumulan las proteínas lisosomales, obligándola a formar como una pequeña
yema que se suelta (por gemación) del complejo de Golgi y forma una vesícula revestida de clatrina. Esas vesículas llevan unidos, de dentro a afuera.

- Proteínas lisosomales: situadas en el lumen de la vesícula pero unidas, por la manosa 6-fosfato, a la por-ción del receptor de la manosa 6-fosfato situada en el lumen del Golgi.
- Receptor de la manosa 6-fosfato: proteína transmembrana del Golgi, con un dominio dirigido hacia el lu-
men, un dominio que a-traviesa la membrana del Golgi de parte a parte y un dominio dirigido ha-cia el citosol, al que se u-ne la adaptina.
- Adaptina: proteína cito-sólica unida al trisquelión de clatrina.
- Clatrina: en el citosol también, formando alre-dedor de la membrana y las adaptinas el revestí-
miento de la vesícula.
Los lisosomas contienen un conjunto de más de 50 hidrolasas ácidas (es decir enzimas hidrolíticas cuyo pH óptimo de actuación es ácido) que les permiten degradar (por hidrólisis) todo tipo de biopolímeros: 
Proteínas..por proteasas (llamadas catepsinas: A, B, C, D, E, H, L, M, O, R, S, etc.). 
Ácidos nucleícos.. por nucleasas (ribonucleasas y desoxiribonucleasas). 
Polisacáridos.. por glucosidasas (?-1,4-glucosidasa o maltasa ácida, etc.).
Lípidos..por lipasas (esfingomielinasa, glucocerebrosidasa, etc.)