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Darwin fue un naturalista inglés que estudió e investigó la historia de las distintas especies de seres vivos. En base a sus experimentos y observaciones, este formuló su famosa teoría de la evolución. Esta teoría defiende que el proceso de la vida se desarrolló en base a dos factores principales: las mutaciones genéticas y la selección natural. Según él, las mutaciones se producen de forma aleatoria y, dependiendo de las condiciones ambientales en las que se encuentra el individuo, dicha mutación puede ser ventajosa o no. Por este motivo, la selección natural actúa sobre dicho organismo de tal manera que si la mutación es ventajosa, este sobrevivirá y podrá reproducirse con el objetivo de proporción dicho gen a su descendencia y garantizar la superviviencia de la especie.

En base a esta teoría, podemos obtener dos contra argumentos para el argumento del relojero de Paley.

Si el ser humano fuese perfecto, tal y como dice Paley, no representaría algunas imperfecciones como que padece enfermedades. Es por esto por lo que la idea de que los seres vivos hayan sido fruto del ensayo y error, no sea una locura.

Por otra parte, debemos tener en cuenta que la selección natural es un proceso de una lentitud colosal, por lo que la situación actual de los seres vivos en cuanto a gente tica se refiere, ha ido cambiando desde el inicio de la vida hasta hoy en día. La mejor manera de visualizarlo es imaginándonos una montaña infinita.

El comienzo de la vida sería la base de dicha montaña y a medida que la vamos escalando nos encontraremos con cambios en el terreno de la misma, representando estos las mutaciones genéticas. La selección natural en este ejemplo sería representada como la gravedad, ya que una formación rocosa inestable sería derrumbada por esta. De esta manera, las especies que perduran a día de hoy son aquellas que han conseguido escalar la montaña de la vida de forma exitosa hasta ahora. Nosotros, los seres humanos, somos una de ellas, pero eso podría cambiar en un futuro.