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Para ordenar la diversidad viviente se utiliza un sistema de clasificación. Reino, phylum. sub, clase, super, orden, sub, familia, sub, genero, especie, sub. Jerárquico, nomenclatura binomial, las categorias mayores son las taxas.  Para reconstruir la filogenia de un grupo se utiliza un carácter que varia entre los miembros (caracter ancestral). Se utiliza ademas para comparar grupo externo (outgroup) este es filogenéticamente cercano, pero no forma parte del grupo de estudio. Para cualquier tipo de reconstrucción filogenética necesitamos considerar los caracteres que vamos a utilizar en nuestro análisis y determinar cual es la condición primitiva que presenta el antecesor común de varios. En este sentido, se utilizan las apomorfias,que
se refieren a un carácter derivado o especializado. Por contra, plesiomorfo, es un carácter primitivo. autopomorfíaes una especialización única en un grupo y una sinapomorfíaes un carácter especializado en dos o más grupos. una simplesioformiaes un carácter primitivo compartido. Todos estos términos pueden ser definidos en relación a cualquier nivel taxonómico. Así, la presencia de hemipenes en una autopomorfía en los Escamosos y una sinapomorfía en Lacértidos y Ofídios. Entre los Reptiles es un carácter primitivo o simplesiomorfo. Escuelas de clasificación: Evolutiva( Es la más antigua y subjetiva. Los caracteres que presentan diferentes poblaciones indican antecesores comunes, de manera que se puede intentar establecer un árbol que los establezca.Se ha de estudiar la homología, pero teniendo en cuenta las posibles convergencias evolutivas. El investigador elige que caracteres son importantes.La presencia de un solo carácter común puede ser suficiente para que la escuela establezca un nuevo taxón) Fenetica ( Se da un valor igual a todos los caracteres.Se estudian los caracteres homólogos, y otros que no está demostrado que lo sean. Únicamente se ignoran las analogías.Cuantos más caracteres se estudien, menor importancia tendrán los posiblemente homólogos.Se pueden establecer árboles que indiquen la cercanía evolutiva. Cladista (Se estudian sólo los caracteres homólogos, y en caso de tener dudas, se estudiará el carácter para saber si es
homólogo. Si a pesar de todo no se sabe con seguridad, se dejará de lado el carácter. Se seguirá un programa, de manera que al finalizar, se obtendrán diferentes árboles, que además indicarán un número
de pasos, siendo el adecuado el que tenga menos pasos, es decir, la máxima parsimonia, ya que la evolución siempre va hacia delante. Especie grupo de poblaciones que pueden reproducirse entre ellas y que están genéticamente aisladas de otros grupos por mecanismos de aislamiento reproductivo, como la esterilidad de los híbridos o la aceptación del macho por las hembras. Protoctistas: No son animales, como tales, en este reino se combinan todos los animales unicelulares eucarioticos, las algas y los hongos mucilaginosos. Es un grupo parafiletico. Son organismos eucariotas que presentan ciertas particularidades celulares. No presentan desarrollo embrionario.No tienen semillas, ni poseen esporas.La mayoría son unicelulares, pero los hay pluricelulares e incluso colonias.Nunca tienen tejidos, aunque se trate de organismos pluricelulares. Todas las células son totipotentes, y aunque se de una especialización, eso no conllevará un cambio de la estructura celular.Nivel de organización protoplásmico.La mayoría son de vida libre, pero también los hay sésiles. Se agrupan por la característica de ser células eucariotas sin tejidos. Actualmente se han escindido en muchos reinos.Son los antecesores de otros reinos: animal,...; pero lo son de manera independiente.Según su metabolismo podemos distinguir entre:Protofitos:Son organismos que realizan la fotosíntesis.Antes se les consideraba auténticos vegetalesProtozoos:Son organismos quimiorganotrofos, es decir se alimentan de lo que producen otros.Antes eran animales de pleno derecho.Pseudohongos: Son organismos que presentan una afinidad con los hongos.Son organismos quimiorganotrofos saprofíticos.Antes eran vegetales. Viven en agua dulce-salada, suelo, materia en descomposición, plantas. Simbiosis de todo tipo, contaminacion de aguas, son el plankton, causan enfermedades, importantes en la cadena alimenticia.Pueden vivir aisladamente o formar falsas colonias, uniéndose varios organismos, pero sin perder la totipotencia.También los hay que forman verdaderas colonias, lo que puede provocar una división del trabajo entre los distintos individuos, encargándose unos de la reproducción y otros no.Son organismos pequeños de entre 10 y 15 ?m
-Se conocen más de 64.000 especies diferentes.Pueden ser organismos polinucleados, y en ese caso se denominan Polinérgides, ya que cada núcleo tiene un dominio denominado sinérgide, que no interacciona con otras sinérgides.Existen registro fósiles desde hace 100 millones de años. Tienen gran importancia económica.Cerca de 10000 especies viven como simbiontes en animales o plantas, y algunos incluso en otros protozoos.La relación puede ser mutualista, comensalismo o parasitismos. Estructura:Como células presentan muchas similitudes con las animales. Membrana celular: Es una doble membrana lipídica típica, que puede dar forma al organismo.En su parte externa podemos encontrar sustancias orgánicas o inorgánicas, que podrán crear el esqueleto del organismo y darle forma.Las sustancias dependerán del protozoo: Flagelados: celulosa. Rizópodos: quitina, silicio o carbonato cálcico.Otros pueden formar expansiones hechas de espinas, espículas.En el interior de la membrana podemos encontrar varias sustancias que le dan resistencia y que se conocen como corteza.Si faltan esas estructuras, el protozoo será asimétrico. Citoplasma (Ectoplasma-endoplasma), Núcleo (binuclaer), Golgi, Mitocondrias,  Vacuolas (abundantes), Cilios y flagelos. Locomoción (Pseudopodos, cilios, flagelos). Metabolismo: fotoautotrofos, heterotrofos. Excreción (vacuola, sifusión), Respiración (difusion). Reproducción (sexual: conjugacion. Asexual: fision binaria, mitosis)  REINO PROTISTA SUB REINO PROTOZOA PHYLUM SARCOMASTIGOPHORA Subphylum Mastigophora Clase Phytomastigophora Clase Zoomastigophora
Subphylum Opalinata Subphylum Sarcodina PHYLUM LABYRINTHOMORPHA PHYLUM APICOMPLEXA PHYLUM MICROSPORA PHYLUM ASCETOSPORA PHYLUM CILIOPHORA.

Organismos multicelulares: Mesozoa (unico phylum) Parazoa (phylum porifera, esponjas y placozoa) Eumetazoa (demas phyla).Contribuciones biologicas:  1. Aunque son los más simples en organización de todos los metazoa, estos grupos realmente componen un nivel más alto de integración morfológica y fisiológica en comparación a las colonias protozoicas. Mesozoa ya pertenece al nivel de organización celular.2. Los Mesozoas, están compuestos de una capa de células somaticas externa y una capa de celulas reproductivas interna. Los mesozoas son
todos parásitos.3. Los Placozoas estan compuestos de dos epitelios con fluído y algunas células fibrosas entre estos.4. Las Esponjas (porifera) son más complejas con varios tipos de células diferenciadas por función. Algunas de las cuales se organizan en tejidos incipientes de un nivel bajo de integración.5. Los patrones de desarrollo de estos tres phyla y etapas embrionales no son homólogas a las de los Eumetazoa.6. Las esponjas han desarrollado un sistema único de corriente de agua el cual les provee de alimento y oxigeno. Origen de los metazoos (Teoría sincitial (Surgen de un ciliado sincitial en el que se desarrollaron limites celulares. Eran formas bilaterales parecidos a Plathelmintes. Favor: Tamaño.Forma.Simetría.Situación de la boca.Ciliación superficial.Contra Diferencias entre ciliados y platelmintos acelos.Desarrollo embrionario complejo en platelmintos Interior celular, no sincitial.) Teoría colonial (Surgen de flagelados coloniales con células mas especializadas e independientes.Son polifileticos y evolucionaron independientemente de varios grupos ancestrales) Phylum placozoa (una sola especie, animal marino 2 a 3mm. digestion interna, grupo hermano del phylum cnidaria) Mesozoa (Parasitos de invertebrados marinos. 0.5 a 7mm con 20-30 celulas en dos capas) Porífera (Pluricelulares de una organización laxa entre las células.Poros (ostiolos) con cámaras para el paso de agua.Simetría radiada o sin simetría
Epidermis con Pinacocitos, Cavidades internas con coanocitos; Mesogloae con amebocitos y elementos esqueléticos.Espongina con esqueleto y colágeno.Digestión intracelular.Excreción y osmoregulación por difusión.Sésiles.Reproducción asexual) Tipos de celulas en las esponjas (Pinacocitos:cubierta externa. Coanocitos. Arqueocitos). Fisiologia de las esponjas (Filtradores, alimento(detritos,placton,bacterias)Digestion intracelular) Tipos de esqueletos (Fibras de colágeno, esponginas, espiculas). Reproducción (anfiblastula (larva hueca, inversion) parenquimula (larva solida, se asienta). Clasificacion de las esponjas (Reino animalia, sub parazoa, phylum porifera, clase calcarea (espicula caliza, marinas, asconoides), hexactinellida (espicula de silice, cuerpo cilindrico, marinas), demospongiae (espiculas de silice, leuconoides, casi todas marinas). Phylum cnidaria (Simetría radial o birradial.Organización tisular (sin órganos)2 (3) capas germinales:Ectodermo,Endodermo
(Mesodermo derivado del ectodermo)Mesoglea (capa intermedia de mucosaccharidos y proteínas).Cavidad gastrovascular con gastrodermis y digestión extracelular e intracelular.Tentáculos.Plexo nervioso con protoneuronas (sin sistema nervioso central).Órganos sensoriales (estatocistos, ocelos).Contracciones musculares o paletas natatorias (ctenóforos).Polimorfismo (estados pólipo y medusa). Nematocistos (órganos urticantes) y coloblastes (adhesión). Hábitats marinos y agua dulce.Zonas de poca profundidad y pocas especies en altas
profundidades.Mas diversidad den aguas cálidas.Constructores de arrecifes e islas.Simbiosis con otros animales y con algas.Animales comedores de corales usan los nematocistes para su propia defensa. Locomocion (Contraccion del cuerpo, tentaculos.deslizamiento sobre disco basal.flotar con una burbuja de gas) Alimentacion (pequeños crustaceos, cazan con tentaculos, la boca se desliza encima de la presa, digestion en la cavidad vascular) Reproducción (AsexualEvaginaciones de yemas. Sexual|fertilizacion de ovarios por espermatozoides vertidos en el agua) Clases Hidrozoos (marinos coloniales), escifozoos (medusas comunes), cubozoos, antozoos (corales y anemonas de mar). Phylum Ctenóforos (Simetría birradial.Peines (paletas natatorias) dispuestas lateralmente para nadar.Triblásticos con ectodermo, endodermo y mesogloea con células dispersas y fibras musculares.Celulas adhesivas (coloblastos).Plexo nervioso subepidermico y órgano sensorial aboral.Monoicos; gónadas en la partes de los canales digestivos.Larva diploide con desarrollo directo bioluminiscencia) Sistema digestivo (boca, faringe, estomago, serie de canales,  poros anales) Habitat (aguas calidas, superficie, aguas profundas) Clase tentaculata, nuda.