Optimización de la precisión y corrección en la medición de la expresión génica y proteómica
Precisión y Corrección en la Medición de la Expresión Génica y Proteómica
Precisión
Mejoras en el hardware: robots de impresión de chips, sensores, etc.
Mejoras a nivel computacional: selección de oligos, análisis de imágenes, determinación y tratamiento del background, compensación por no-linealidad de las señales que se miden, etc.
Corrección
Íntimamente relacionado con la interpretación de los datos: ¿cómo traducir intensidades en niveles de mRNA dentro de la célula?
Se aplica por igual a microarrays, Northern blots, cuantitative PCR (qPCR).
Multiplicación de ruido (error) que lleva a inconsistencias sistemáticas.
Total RNA
Supone que en cada punto del ensayo las células tienen el mismo contenido de RNA total. La misma cantidad...